2023年05月31日发布 | 766阅读
肿瘤

YAP/TAZ通路活化调节GBM干细胞

李慧堂

新乡医学院第一附属医院

徐涛

海军军医大学附属长征医院

花玮

复旦大学附属华山医院





































































































































意大利帕多瓦大学分子医学系的Martina Castellan等使用单细胞数据集,识别GSC的基因调控网络,确定GSC位于GBM分化阶段的顶端,并发现YAP/TAZ是GSC的关键分子引擎。结果发表于2021年2月的《Nature Cancer》杂志。


——摘自文章章节


Ref: Castellan M, et al. Nat Cancer. 2021 Feb;2(2):174-188. doi: 10.1038/s43018-020-00150-z. Epub 2020 Dec 7.


研究背景




胶质母细胞瘤(GBM)是一种预后极差的恶性脑肿瘤。在细胞水平上,GBM的许多恶性特征都通过GBM干细胞(GSC)发挥;GSC具有自我更新能力,在体内启动肿瘤发生,并能分化出子代细胞。但GSCs的分子标志和影响因素仍然知之甚少。意大利帕多瓦大学分子医学系的Martina Castellan等使用单细胞数据集,识别GSC的基因调控网络,确定GSC位于GBM分化阶段的顶端,并发现YAP/TAZ是GSC的关键分子引擎。结果发表于2021年2月的《Nature Cancer》杂志。


研究方法



作者对32例IDH野生型GBM肿瘤进行单细胞(sc)RNA测序;然后在TCGA和REMBRANDT数据集中对单细胞测序分析的结果进行验证。使用Monocle进行拟时序分析,鉴别GSC样细胞,再进一步展示GBM细胞分化的自然轨迹。接着行基因本体论GO分析,结合典型的GSC样细胞基因(G-STEM),采用Neftel等的scRNA-seq数据集进行整合,获得具有多个分支的伪时间轨迹。在伪时间轨迹起始,通过高表达的G-STEM特征识别肿瘤细胞,应用G-STEM对来自TCGA和REMBRANDT两个大型数据库的GBM患者进行Kaplan-Meier生存分析,从而验证G-STEM特征与患者预后的相关性。


通过ARACNE和VIPER等一系列算法,最后筛选出转录共激活因子YAP和WWTR1(即TAZ)。作者在GBM中敲除YAP/TAZ,验证YAP/TAZ活性与GSCs之间的关系;通过免疫组化(IHC)对人GBM切片中活化的TAZ进行定量。


为阐明胶质瘤形成的早期步骤,将编码PDGFR-α、EGFR或HER2致癌基因活化的慢病毒载体转导至新生小鼠星形胶质细胞中,同时包括编码致癌KRasG12V加上针对p53的短发夹(sh)RNA或针对NF1和p53的shRNA。用YAP/TAZ敏感的慢病毒8xGTIIC-RFPDD转导至早期星形胶质细胞;然后在癌基因介导的重编程过程中监测红色荧光蛋白(RFP)的表达,从而验证YAP/TAZ是否在获得GSC样状态时被致癌突变激活。从新生的R26CAGCreERT2、Yapfl/fl、Tazfl/fl小鼠中分离出星形胶质细胞,通过4OH-TAM(4OH-TAM)处理Cre激活后,诱导YAP/TAZ的遗传消融,验证癌基因介导、将正常细胞重编程为GSC样细胞是否需要YAP/TAZ。作者进一步用RNA-seq对Yapfl/fl、Tazfl/fl小鼠星形胶质细胞进行转录组分析,通过使用HER2CA显著改变表达的基因对样本进行分层聚类,从而在分子水平上研究了YAP/TAZ如何促进正常神经细胞向GSC的致癌重编程。


最后,作者在免疫缺陷小鼠大脑原位注射GBM细胞,使用转化的Yapfl/fl、Tazfl/fl细胞携带shNF1/shp53或KRasG12V/shp53和双荧光素酶-gfp表达载体;在免疫能力强的同基因小鼠大脑中注射表达抗YAP/TAZ强力霉素诱导shrna的GL261或CT2A,验证YAP/TAZ是否是GSCs在体内的主要特征之一,即肿瘤起始所必需的。


研究结果



该研究结果表明,单细胞测序的拟时序分析可以识别早期的GSC。当关注不同亚型GBM(如前神经、经典或间充质)时,G-STEM总是在伪时间轨迹开始时富集,显示所有GBM亚型的GSC样细胞都具有G-STEM特征。Kaplan-Meier生存分析,得出G-STEM特征代表一种新的转录程序,该特征在GBM分化层次处于顶端的早期GSC中。


对GSC进行评分分析,发现YAP/TAZ活动是定义GSC状态的一个首要因素。当YAP/TAZ野生型肿瘤持续扩大时,敲除YAP/TAZ会抑制肿瘤生长,这与肿瘤致瘤细胞群中GSC缺失的结果一致,YAP/TAZ是维持GSC状态所必需的。在体内,这种状态是由YAP/TAZ依赖的G-STEM信号识别。通过免疫组化和检测Ivy Atlas的坏死区,表明GBM坏死周围区域确实有GSC富集,G-STEM的表达峰值与TAZ峰值区域一致。


新生小鼠的星形胶质细胞中引入活化的致癌基因后,RAS/RTK致癌基因过表达将其转化为具有GSC特性的细胞,在体内外具有致瘤和自我更新的能力。RNA-seq分析发现,肿瘤显示出G-STEM特征高表达,而DGC特征表达降低。荧光监测表明,YAP/TAZ激活是正常星形胶质细胞重编程为致瘤性gsc样细胞的早期事件,YAP/TAZ在GBM起始过程中的主要功能是抑制分化,促进获得干细胞样特征。在人GBM细胞中,分化/去分化方案证实YAP/TAZ为GBM细胞内在分化所必需,YAP/TAZ消耗可诱导干细胞球逐步分解和消亡;在分子水平上研究YAP/TAZ消融的结果表明,YAP/TAZ在GSCs中主要作用在于阻止其神经元谱系分化。


通过生物发光和组织学分析发现,将亲代GBM细胞注射到小鼠颅内后,可形成侵袭性强的较大肿瘤团块。相比之下,YAP/TAZ敲除细胞未能成瘤;在免疫功能缺陷小鼠中结果类似,证实YAP/TAZ对于肿瘤的发生和体内分化都是必需的。


研究结论



总之,通过重建GSC的调控网络,作者发现YAP/TAZ共激活是干细胞状态的主要调节因子,而与GBM亚型无关;YAP/TAZ激活是GSC分化的主要障碍。该研究在GSC原生状态的关键分子基础上取得进展,揭示恶性脑胶质瘤治疗的新思路。


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