意大利比萨圣朱利尔梅比萨纳基金会基因组学和转录组学研究所的Francesca Lessi等收集3例GB标本，通过单细胞分离筛选系统DEPArray分离出一定数量的单细胞，进行测序，重点分析四种细胞群：星形胶质细胞、小胶质细胞、内皮细胞和干细胞。通过基因组分析，揭示GB微环境的分子特征，结果发表在2022年3月的《Cells》在线。
——摘自文章章节
【Ref: Lessi F, et al. Cells. 2022 Mar 26;11(7):1127. doi: 1 0.3390/cells11071127.】
胶质母细胞瘤（GB）是成人侵袭性原发性恶性脑肿瘤，肿瘤微环境（TME）在GB出现耐药性起关键作用。GB微环境由大量不同的细胞组成，除恶性星形胶质细胞和肿瘤干细胞外，还包括基质细胞、内皮细胞、周细胞和大量的淋巴细胞。意大利比萨圣朱利尔梅比萨纳基金会基因组学和转录组学研究所的Francesca Lessi等收集3例GB标本，通过单细胞分离筛选系统DEPArray分离出一定数量的单细胞，进行测序，重点分析四种细胞群：星形胶质细胞、小胶质细胞、内皮细胞和干细胞。通过基因组分析，揭示GB微环境的分子特征，结果发表在2022年3月的《Cells》在线。
作者首先使用DEPArray分离3例IDH野生型GB新鲜组织（GB01、GB02和GB03），分别测得2654、9535和4278个细胞。作者选择4种不同的常规标记识别GB中4种最具代表性的亚群：GFAP+星形胶质细胞（GFAP+）、IBA1+小胶质细胞（IBA1+）、CD105+内皮细胞（CD105+）和CD133+干细胞（CD133+）；并对单细胞进行拷贝变异分析和测序。总体来说，3例标本都有10q缺失，GB01和GB02存在7号染色体扩增，符合GB特征，同时拷贝变异异质性较大。
单细胞测序分析发现，在GB01中，GFAP+占75.8%，IBA1+占23.3%。有1个血管内皮样细胞呈野生型；6个小胶质细胞样细胞中，2个是野生型，1个仅显示19号染色体缺失。其它细胞显示不同的基因组改变，但共享10号染色体缺失，以及7、9q和17q号染色体扩增。6个星形胶质细胞中，1个具有1p和10号染色体缺失以及7、9、17q和19q染色体扩增的干细胞。此外，在GB01中，还发现两个具有双重染色的细胞（GFAP+和IBA1+）。四分之三的未染色细胞是野生型，1个表现为1p、10和17p染色体缺失以及7、9q、17q和19q染色体扩增。在GB02中GFAP+占68.9%，IBA1+占27.9%，CD105+占2.67%。8个内皮细胞中，2个是野生型，其它为19号染色体缺失；只有1个具有9p、10、13q、14q和22q染色体缺失。在6个星形胶质细胞中，1个是野生型，1个具有19号染色体缺失，其它则共享9p、10、13q、14q和22q染色体缺失。在5个单一的小胶质细胞中，2个野生型，3个有19号染色体缺失。在GB02中，6个双染细胞（CD133+和CD105+），其中4个为野生型，其它共享10、13q、14q和22q染色体缺失。
GB03中，GFAP+占77.4%，IBA1+占0.77%，CD105+占21.81%。6个内皮细胞中，4个野生型，另外2个呈不同变异，特别是9p、10和22q染色体缺失和7、9q和20染色体扩增。5个小胶质细胞均为野生型。6个星形胶质细胞中，1个是野生型，而其它细胞显示相同的改变：9p、10和22q染色体缺失和chr 7、9q和20染色体扩增。
综上所述，作者通过4个细胞亚群标记从新鲜GBM中分离出单细胞：星形胶质细胞、小胶质细胞、内皮细胞和干细胞。单细胞测序的基因拷贝变异分析能够区分肿瘤微环境中的细胞类别，这种分析方法非常灵敏、准确地显示分子特征，有助于了解肿瘤发展机制。
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