神经外科是国家临床重点建设专科、国家神经外科医师培训基地、国家住院医师规范化培训专业基地、教育部工程技术研究中心、国家药物临床试验机构、国家脑卒中筛查与干预基地、南方医科大学广东神经外科研究所、广东省“脑功能修复与再生实验室”重点实验室，广东省颅脑外科质量控制中心、《中华神经医学杂志》编辑部所在单位，是临床医学博士后流动站主干学科、广东省高校重点学科、广东省医学重点专科、广东省最早被国务院批准的神经外科专业硕士授权学科、华南地区首家神经外科专业博士授权学科。 神经外科根据疾病谱及专业特点，下设5个专科（神经肿瘤外科、功能神经外科、脑血管病外科、小儿神经外科、神经创伤重症科）和1个实验室。 学科带头人柯以铨教授任国家临床重点专科主任、教育部工程技术研究中心主任、全国神经外科专科医师规范化培训基地主任、世界华人神经外科协会委员、中华医学会神经外科学分会第八届委员会全国委员、中国神经科学学会神经损伤与修复分会副主任委员、卫计委脑卒中防治专家委员会出血性外科专业委员会常务委员、广东省医师协会神经外科医师分会主任委员、广东省医学会神经外科学分会副主任委员、广东省医院协会临床科主任管理分会副主任委员、广东省颅脑外科质量控制中心主任，广东省神经科学会常务理事、南方医科大学学位评定委员会委员、南方医科大学广东神经外科研究所所长。《中华神经医学杂志》《中华神经创伤外科电子杂志》副总编辑，“Neurosurgery”中文版、《中华神经外科杂志》《中国微侵袭神经外科杂志》等多家杂志编委。