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为探索中国人群中多基因风险评分与卒中及其亚型风险的关联强度,北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系吕筠教授团队在Stroke & Vascular Neurology杂志发表题为《中国人群多基因风险评分与卒中及其亚型风险的相关性研究》(Associations of polygenic risk scores with risks of stroke and its subtypes in Chinese)的原创研究论文。研究结果显示多基因风险评分与卒中及其亚型风险的关联强度中等,表明基于中国人群基因背景代表的东亚人群中,在GWAS基础上形成的多基因风险评分体系并没有比现有的风险评估体系体现出对患者的卒中风险进行更有价值的风险预测能力,提示多基因风险评分体系目前对于卒中发病风险预测价值有限。 [Yang S, Sun Z, Sun D, Yu C, Guo Y, Sun D, Pang Y, Pei P, Yang L, Millwood IY, Walters RG, Chen Y, Du H, Lu Y, Burgess S, Avery D, Clarke R, Chen J, Chen Z, Li L, Lv J; China Kadoorie Biobank Collaborative Group. Associations of polygenic risk scores with risks of stroke and its subtypes in Chinese. Stroke Vasc Neurol. 2023 Aug 28:svn-2023-002428. doi: 10.1136/svn-2023-002428. Epub ahead of print. PMID: 37640499.] 1 研究背景 卒中是全球死亡和疾病负担的主要原因之一。卒中包括两种主要亚型,如缺血性卒中和出血性卒中,后者可进一步分为脑出血和蛛网膜下腔出血。 多基因风险评分(PRS)是一种将整个基因组中较小的遗传效应结合起来的方法(备注:一般情况下,对于单基因疾病(孟德尔遗传病)来说,只有单个或少数基因对表型有很大的影响,与之相对,对于复杂疾病来,通常有大量的遗传位点对表型有较小的影响,目前GWAS研究多基于CDCV或无限小假设,这种情况下单个变异不足以用来评估个体对某一复杂疾病的风险,所以为了找到一个能够评估个体疾病风险的值,PRS(多基因风险评分)就应运而生,PRS的概念简单说就是,总和多个遗传变异与表型关系的数值。PGS是基因组上与表型相关等位基因的加权线性组合(权重通常为GWAS中估计的效应量),已越来越多地用于卒中研究。以欧洲人群为基础的几项研究报道了多基因风险评分或可实现卒中的风险分层。 最近的研究提示基于中国人群基因背景开发的PRS在预测缺血性卒中和出血性卒中的风险方面可能显示出类似的关联强度,而缺血性卒中和出血性卒中可能有不同的病因机制,不同的卒中亚型也有其特定的遗传位点。因此,作者团队旨在探究中国人群中PRSs与卒中及其亚型风险的关联强度。 2 研究方法 本研究基于中国慢性病前瞻性研究(China Kadoorie Biobank, CKB)基因组数据的亚队列,将拥有全基因组基因型数据的参与者分为潜在训练集(n=22191)和基于人群的测试集(n=72150),其中包括4种先前研发的PRSs,并开发了针对卒中及其亚型的新PRSs。在训练集中显示与卒中或其亚型风险最强相关的PRSs,并在测试集中进一步评估。Cox比例风险回归模型用于估计不同PRSs与卒中及其亚型风险的关联强度,包括缺血性卒中、脑出血及蛛网膜下腔出血。 3 研究结果 在这项研究中,定义了四个1:1匹配的训练集,以确定任何卒中(7412对)、缺血性卒中(3844对)、脑出血(4296对)和蛛网膜下腔出血(359对)的最佳PRS(图1)。 图1 研究结果显示,在测试集中,872919人年的随访期间,记录了8514起卒中事件,包括7507例缺血性卒中、1193例脑出血和132例蛛网膜下腔出血。对于任何卒中、缺血性卒中和脑出血,任何卒中的PRS每SD增量的HR(HRSD)分别为1.10(95%CI 1.07 to 1.12)、1.10(95%CI 1.07 to 1.12)及1.13(95%CI 1.07 to 1.20)。缺血性卒中的PRS相应的HRSD为1.08(95%CI 1.06 to 1.11)、1.08(95%CI 1.06 to 1.11)及1.09(95%CI 1.03 to 1.15)(图2)。脑出血的PRS与ICH风险呈正相关(HRSD=1.07, 95%CI 1.01 to 1.14)。蛛网膜下腔出血的PRS与卒中及其亚型风险无关。目前PRSs的增加对于卒中风险预测与风险分层几乎没有改善。 图2 4 研究结论 基于中国人群基因背景代表的东亚人群中,在GWAS基础上形成的多基因风险评分体系并没有比现有的风险评估体系体现出对患者的卒中风险进行更有价值的风险预测能力,提示基于目前的东亚人群全基因组关联研究背景下,多基因风险评分体系目前对于卒中发病风险预测价值有限。 通 讯 作 者 声明:脑医汇旗下神外资讯、神介资讯、神内资讯、脑医咨询、Ai Brain 所发表内容之知识产权为脑医汇及主办方、原作者等相关权利人所有。