香港中文大学解剖及细胞病理学系的Liang Hong等通过全基因组甲基化分析和NGS为儿童IDHwt、H3wt胶质母细胞瘤提供一个全面的分子图谱,并探索其临床意义;结果发表在2022年3月的《Laboratory Investigation》在线。
——摘自文章章节
【Ref: Hong L, et al. Lab Invest. 2022 Jul;102(7):731-740. doi: 10.1038/s41374-022-00769-9. Epub 2022 Mar 24.】
2021版WHO中枢神经系统肿瘤分类将儿童期H3野生型(H3wt)和IDH野生型(IDHwt)胶质瘤定义为儿童高级别胶质瘤,但目前认为它们仅具有IDH和H3阴性分子突变特征;不清楚该类胶质瘤特定的分子或组织学特征。香港中文大学解剖及细胞病理学系的Liang Hong等通过全基因组甲基化分析和NGS(包括靶向测序和RNAseq)为儿童IDHwt、H3wt胶质母细胞瘤提供一个全面的分子图谱,并探索其临床意义;结果发表在2022年3月的《Laboratory Investigation》在线。
该研究纳入35例IDHwt、H3wt儿童半球胶质母细胞瘤,通过全基因组甲基化分析、靶向测序、RNAseq、TERT启动子测序和FISH等对其进行评估。35例患者的中位生存期为27.6个月。基于Capper等的36个甲基化组图谱,发现患者具有表观遗传学异质性,8例主要聚集在PXA-like组、10例LGG-like组、9例GBM_MYCN组、5例GBM_midline组和3例GBM_RTKIII组等甲基化组。35例患者甲基化组的肿瘤组织学与普通胶质母细胞瘤无明显差异。甲基化组与总生存期无关。EGFR、PDGFRA和MYCN扩增与总生存期无关。4/9例GBM_MYCN组无MYCN扩增;4/9例患者EGFR扩增,2例有两种生物标志物的重叠。在该35例患者中,4例患者存在PDGFRA扩增,但不局限于任何甲基化组。GBM_midline组的病例均为半球胶质瘤,表现为H3K27me3缺失。在17例进行测序的婴儿胶质母细胞瘤中均未检测出特征性融合基因ALK/NTRK/ROS1/MET。BRAF V600E仅存在于PXA组,其它甲基化组均存在CDKN2A缺失。PXA-like组病例未表现出与既往研究相似的PXA组织学特征。该队列患者未见TERT启动子突变。单因素分析发现错配修复(MMR)基因突变是预后较差的预测因子(p≤0.001),但在多因素分析中,则不是(p=0.229)。MGMT状态在该队列患者中无明显预后价值。在其它常见的生物标志物中,只有TP53和ATRX突变是显著的预后不良预测因子,多因素分析发现,只有TP53突变是显著的预测因子(p=0.024)。
该研究结果表明,IDH野生型、H3野生型儿童半球胶质母细胞瘤具有分子异质性,TP53、ATRX和MMR状态有助于对其进行风险分层。

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