2021年12月28日发布 | 2634阅读

YAP1基因融合与脑膜瘤关系的研究进展

陈嘉伟

复旦大学附属华山医院




















































































































































































































































脑膜瘤是一种起源于覆盖大脑和脊髓的脑膜覆盖层的肿瘤,通常认为其起源于蛛网膜帽细胞。脑膜瘤是最常见的成人颅内原发性肿瘤,约占所有中枢神经系统肿瘤的39.0%,年发病率高达9.12/10万人[1-3]。大量研究表明位于22号染色体q12.2上的NF2基因突变在脑膜瘤的发生发展过程中具有重要作用[4-7]。大量基因测序研究发现超过50%的脑膜瘤病例均携带了NF2基因突变(即NF2突变型脑膜瘤),而在NF2野生型脑膜瘤中则存在着其他驱动基因(如SMOAKT1TRAF7等)[8,9]。NF2基因的编码蛋白Merlin是YAP1信号通路的上游负调控子。在NF2突变型脑膜瘤中,由NF2基因失活造成的Merlin蛋白缺失常常导致YAP1基因的过表达并引起其靶向调控基因的过度转录,并进一步引起下游通路(如Hippo、PI3K/AKT和WNT/β-catenin信号通路)信号的异常增益[10]



YAP1是一种重要的转录共激活因子,在生理条件下它主要参与调节组织内稳态、细胞周期和细胞增殖。然而,YAP1也具有致癌基因的作用。研究发现,YAP1基因是Hippo信号通路的主要效应因子,在包括脑膜瘤在内的大多数肿瘤中过表达[11,12]。YAP1在转录后受到LATS(large tumor suppressor kinase)介导的磷酸化调控,当Hippo信号被激活时,YAP1在Ser127处被磷酸化引起胞浆隔离或者在Ser397处被磷酸化引起酶解[13-15];当Hippo信号减弱时,YAP1被定位于细胞核中,作为转录辅助激活因子发挥其致癌基因的潜力,结合并促进转录因子的TEA结构域(TEAD)家族的转录,最终促进肿瘤细胞的增殖和存活[13,16]。多数研究显示YAP1基因的活性异常升高与多种肿瘤的预后不良和Hippo通路上游分子失活突变联系密切[10,17-19]。然而,也有研究显示YAP1基因的单点突变却十分罕见,这表明单点突变可能不足以造成YAP1的活性异常[20]。反而是通过截短大部分YAP1序列,但保留TEAD相互作用结构域的YAP1基因融合更可能会产生抵抗Hippo信号通路负调控的融合蛋白,并造成YAP1活性的异常增强。Frank Szulzewsky等人的研究证实了上述推测,在小鼠模型中,YAP1基因融合(YAP1-MAMLD1YAP1-FAM118BYAP1-TFE3和YAP1-SS18)具有致癌作用,因为它可以抵抗Hippo信号通路进行核定位和抗酶解作用 ,另外,在体外条件下使用YAP1-TEAD结合抑制剂的干预可以减缓肿瘤细胞的增殖[21]

在2012年,Gilson S. Baia等发现在脑膜瘤中以YAP1核定位的表达增强为代表的Hippo信号通路的异常十分常见,此外,在这种脑膜瘤细胞中YAP1表现出以调节细胞增殖、迁移和凋亡为特征的特性改变[11]


在2020年,Philipp Sievers等对9例脑膜瘤(其中8例脑膜瘤患者年龄小于18岁)病例的肿瘤进行测序分析,结果显示存在YAP1基因融合,共有三种不同的融合形式,分别是YAP1:MAML2、YAP1:PYGO1和YAP1:LMO1,其中YAP1:MAML2是最为常见的融合形式。该研究的患者的基本信息如表1所示 ,YAP1:MAML2、YAP1:PYGO1和YAP1:LMO1的基因融合情况如图1所示[22]


表1. Philipp Sievers研究中的9例脑膜瘤的基本信息


图1. 三种YAP1基因融合示意图。A.YAP1-MAML2融合(融合涉及YAP1的外显子1-5和MAML的外显子2-5);B.YAP1-PYGO1融合(融合涉及YAP1的外显子1-4和MAML2的外显子2-3);C.YAP1-LMO1融合(融合涉及YAP1的外显子1-4和LMO1的外显子2-4)。


在2021年,Kathleen M. Schieffer等在对1例20岁脑膜瘤患者的肿瘤测序和将其与Kids First Data Resource Center (KFDRC)青少年脑膜瘤数据集(共有11例脑膜瘤病例,其中3例为YAP1融合阳性病例)比对的研究中发现了YAP1基因的另一种融合形式,即YAP1-FAM118B融合[23]。该研究通过RNA测序发现了该YAP1-FAM118B融合是一种涉及YAP1(GRCh38:chr11:102223752;NM_001130145 exon 7)和FAM118B(GRCh38:chr11:126234994, NM_024556 exon 3)基因的框内融合(In-frame fusion)(图2A)。YAP1保留了转录增强因子结构域(TEAD)和WW结构域,这两个结构域对该蛋白的致癌和转录调节作用至关重要(图2B)[24-26]。研究者将本例患者与来自KFDRC脑膜瘤数据库的数据比对分析后发现脑膜瘤中的其他基因改变,如NF2、AKT1、TRAF7和SMO(图2C)。研究者还发现在NF2突变型脑膜瘤中NF2基因的表达低于YAP1-FAM118B融合型或AKT1/TRAF7突变型脑膜瘤,而在YAP1基因融合型和NF2突变型脑膜瘤中的YAP1基因的表达没有显著差别(图2D)。通过对YAP1-FAM118B融合型和NF2突变型的脑膜瘤中对变异频率最高的前250个基因进行无监督主成分分析发现,YAP1融合型脑膜瘤具有特殊的肿瘤驱动基因群体(图2E)。


图2.YAP1-FAM118B融合的分子特征。A.Sanger测序结果发现涉及YAP1的外显子7(NM_001130145)和FAM118B基因的外显子3(NM_024556)的框内染色体内融合。在FAM118B的5’段的非翻译区加入7bp后即在启动子蛋氨酸密码子之前增加了3个氨基酸。箭头表示基因融合方向;B.YAP1-FAM118B融合基因的编码蛋白结构;C.该患者与KFDRC脑膜瘤数据的基因突变情况;D.NF2和YAP1在携带驱动基因突变的脑膜瘤中的分布(包括NF2、YAP1-FAM118B和AKT1/TRAF7)(***P<0.001);E.在YAP1-FAM118B融合和NF2突变型的脑膜瘤类型中对变异频率最高的前250个基因进行无监督主成分分析。

同样是在Kathleen M. Schieffer等的研究中,研究者将12例脑膜瘤病例与来自UCSC Treehouse Initiative数据库的563例神经系统肿瘤病例以及3例YAP1融合型室管膜瘤病例组成的整合数据集(共566例)进行比对研究,结果发现脑膜瘤病例表达的EGFR(P<0.0001)和MET(P=0.0004)显著升高,这表明这些酪氨酸激酶受体的过表达可能是肿瘤生物学固有的,而不是驱动基因(图3A)。EGFR和Hippo信号通路之间的串扰是通过激活PI3K/PDK1轴和解离SAV1中的Hippo核心激酶而实现的[27]。随后YAP1移位到细胞核中促进细胞的增殖和生长,然而酪氨酸激酶受体通过RAS-ERK-MAPK、PI3K/AKT和STAT信号转导而激活并促进细胞的存活、分化和生长(图3B)。这些发现表明了脑膜瘤中YAP1激活具有非NF2依赖性的致癌基因潜力。


图3. YAP1-FAM118B脑膜瘤中受体酪氨酸激酶和Hippo信号通路。A.关于脑膜瘤病例(MNG,n=12)和来自UCSC Treehouse Initiative数据库的神经系统肿瘤病例(n=563)以及3例YAP1融合型室管膜瘤病例的整合数据集(NS,n=566)的EGFR和MET表达对比箱型图(***P<0.001);B.在YAP1-FAM118B融合型脑膜瘤中EGFR和MET信号通路以及Hippo信号通路之间的相互作用模型图。
上述这些研究展示了YAP1基因融合在NF2野生型脑膜瘤中扮演的致癌基因的角色,特别是在青少年脑膜瘤患者队列中。然而,我们也需要更多的大型测序研究再进一步验证上述结论,并进一步评估YAP1基因作为脑膜瘤治疗靶点的可能性和可行性,最终提高脑膜瘤患者的临床治疗效果。




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作者简介

陈嘉伟
复旦大学附属华山医院神经外科博士(在读),导师为宫晔教授。目前研究方向为脑膜瘤的免疫治疗及临床应用。




阔然生物医药科技(上海)有限公司(Shanghai KR Pharmtech, Inc. , Ltd.)”简称阔然基因成立于2015年,总部位于上海,致力于提供多应用场景的一站式分子诊断解决方案,包括癌症早期筛查、诊断与监测以及药物研发服务,拥有6款IVD产品注册申报储备,服务中国500余家医院和科研机构,建立了庞大的基因组数据库。阔然拥有上海和徐州双研发中心,两家医学检验实验室(“零缺陷”通过CAP权威认证)和精准医学技术研究院。凭借“产品+服务”模式开展肿瘤分子诊断、免疫微环境和病原微生物检测等业务。为临床医生对患者的诊疗提供一体化解决方案,实现“精准医疗践行者”的理念,推动我国医疗事业发展。旗下有3家企业先后荣获“上海市高新技术企业”、”江苏省高新技术企业“认定。




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