感染性疾病带来巨大的全球疾病负担，明确病原是感染性疾病诊疗的基础。然而在现实中，无法明确病原的情况在重症肺炎中超过四成，在感染中毒症中超过半数，在中枢神经系统感染中则达到50%~70%。

宏基因组测序技术（mNGS），是对患者样本中微生物和宿主遗传物质DNA和RNA的全面分析。如今它正迅速从科学研究转向临床诊断应用，它尤其擅长鉴别罕见、新发、难以检测和混合感染的病原体。如果把传统针对特定病原的检测看成是“钓鱼”，那么mNGS就类似于“大面积撒网捕捞”。自2008年以来，来自20多个国家的大量研究表明，mNGS应用范围广泛，包括病原体检测鉴定、抗生素耐药性分析、微生物组分析、抗感染疗效评价、人类宿主基因表达转录组学和肿瘤学等多个方面。尤其是在诊断不明原因的感染性疾病方面，mNGS表现突出，在药物敏感性预测中具有巨大潜力，成为优化治疗方案和抗菌药物管理的重要辅助检测工具。由此，许多医生认为mNGS是解决临床感染难题的新利器，有望改变医生对感染性疾病的诊断和治疗实践。