1886年，在他最早和最重要的著作之一中，玛里提出了“肢端肥大症”（acromegaly）这一术语，用来描述一名患病妇女的临床特征。这个词源自希腊语单词akron（极端或四肢）和megas（大），直到今天仍用于描述垂体分泌生长激素（GH）过多所致的此类成人疾病；而GH过剩在童年和青春期导致的类似疾病，则被称为巨人症（gigantism）。玛里对脑垂体疾病的分析是对新生的内分泌学领域的一项基础研究与贡献。他发现这种生长异常是垂体功能异常的结果，这使得他同时成为内分泌学的奠基人。

玛里也是最早（1886年）发现“夏-马-图三氏病”（Charcot-Marie-Tooth disease，CMT）的三位医生之一，这是一种外周神经疾患导致的腓骨肌萎缩性的足部畸形疾病，该病的命名正是由三位医生名字合在一起的拼写。除此之外，玛里还定义了肥大性肺骨关节病（1890年）、小脑遗传性畸形（1893年）、锁骨颅骨发育不良（1897年）和脊髓型颈椎病（1898年）。

1897年，他在路易九世创立的Hospice de Bicêtre里工作。在这里，他创建了一项享誉全球的神经学服务。在此期间，他发表了大量关于失语症的文章，并驳斥了Pierre Paul Broca（1824-1880）和Karl Wernicke（1848-1905）关于语言中心区的观点。

他解剖了Broca的一份未受影响的标本，证明病变影响的程度远远超过Broca定位的区域。他的三篇关于失语症的论文于1906年发表在《医学评论》（Semaine Médicale）上，这引发了很多讨论。总之，玛里对关于这一主题的先前工作进行了毁灭性的批评，并且率先描述了失语症与神经系统疾病的关系。

1907年，玛里开始担任医学院病理解剖学教授的职位。在这十年时间里，他全身心地投入到这一工作中，并在他的继任者Gustave Roussy的帮助下，完全实现了医学院病理解剖学教学的现代化，并建立了实验室和博物馆。

1918年，玛里被任命为Salpetrière那家Charcot所创医院的神经学学科主任，一直干到1925年退休。此后，他过着几乎隐居的生活，并越来越多地受到健康问题的困扰，逝于81年前的今天，享年86岁。