2020年06月09日发布 | 1099阅读

机器学习在slicer中的应用(二)

束旭俊

东部战区总医院淮安医疗区

这次主要以视频的方式做教程,全是干货,在上教程之前还需要一些准备工作,Ok, let‘s do it!


1、下载一个较新的slicer版本,建议4.10以后的版本,第一次进论坛需要注册。安装slicer的路径不能有中文。


2、打开slicer应用扩展市场,下载机器学习插件deepinfer,下载好后请重启slicer使其生效。


3、在使用deepinfer之前,我们还需要在PC上进行一些运行环境的搭建,先下载一个叫Docker的软件,需要注册才能下载,注意系统版本。


4、安装Docker对计算机硬件及系统环境都有一定要求,比如windows系统需要64位系统,内存至少4G,主板要开启Hyper-V。


5、docker要安装在C盘,安装好后,打开设置(setting),在share drivers选项中勾选C盘(很重要)。


在Advanced中根据自己电脑配置进行设置,我的是八核处理器16G内存,当然你默认设置也行。


6、启动slicer和docker,可以在电脑桌面右下角任务栏中看到docker图标,将鼠标放在图标上会显示“docker is running” 。


以上六步都完成,我们就可以进入slicer开始利用机器学习来实现颅骨自动分割了。


友情提示:大家可以试试用第一个胸部CT的模型来做颅骨分割。

END

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