2020年01月26日发布 | 1560阅读

三大顶刊最新发表:新型冠状病毒肺炎研究进展

Dr.Liu


内容提要


近日NEJMJAMAThe Lancet等权威杂志紧扣当下热点公共卫生事件,相继发表新型冠状病毒相关论文,借来一读颇有收获。略做翻译,希望为普及知识和减少恐惧尽点绵力。


读完文献有几点信息可以总结:(1)中国CDC等机构行动不晚,快速找到病原体并测出了病毒基因序列,推测该病毒为元凶;(2)有了基因序列可以开发快速检测试剂盒和疫苗,为正在进行的抗疫斗争提供诊断和防御武器;(3)病毒社区传播的条件可能限于有下呼吸道症状患者(咳嗽、咳痰等),唾液飞沫和直接接触是主要传播载体/形式;(4)恐慌是社会和应对疫情的大敌;(5)目前研制疫苗的时间有望缩短在3个月内。

随着本次病毒疫情发展,各种信息也如病毒一般扩散,让人难辨真假!这似乎也能理解,即使是普通的医疗工作者,也不敢轻言了解新型病毒。我们不妨化繁为简,去追溯那些揭示病毒真面目的“一手”资料,获取关于新型病毒的权威知识!

A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019

题目:2019年中国肺炎患者中发现新型冠状病毒

期刊:N. Engl. J. Med. 2020 Jan 24

(本内容力图对文献要点进行翻译,仅做参考!有兴趣者请参阅原文)


点击此处,即可查看原文


冠状病毒是一种RNA病毒,具有遗传多样性和频繁的基因重组特性,加之人畜接触的增加,新型冠状病毒在人类社会呈周期性出现

2019年12月31日中国疾病防治中心(CDC)派出快速反应分队到湖北,开展流行病学研究。2020年1月24日在医学杂志NEJM报道了疾病爆发早期在肺炎患者中检测到一种新型冠状病毒,并命名为2019-nCoV

研究对象为2019年12月间收入武汉某医院的3例患者。患者1为49岁女性,患者2为61岁男性,患者3为32岁男性。患者1为海鲜市场零售人员,无慢性基础疾病史,表现为发热(37-38℃)以及咳嗽伴胸部不适。4天后咳嗽及胸部不适加重,但是发热好转,CT检查提示肺炎。患者2经常出入海鲜市场,初始表现为发热和咳嗽,7天后呼吸症状进展,2天后继续加重。患者1和3在2020年1月16日康复出院,但是患者2于2020年1月9日不幸离世。

本次疫情的起源地,图片来自网络
 

死亡患者发病第8日(A)和第11日胸片表现(B),右图明显加重
 
研究者提取支气管肺泡灌洗液标本,PCR技术分析提取的核酸标本。病毒接种人呼吸道上皮细胞96小时后可观察到病变反应。

普通显微镜下人类呼吸道上皮细胞接种该病毒后的变化(A为对照)
 
电镜检查发现其是一种具有一定多形性的圆形病毒,直径60~140 nm。从三个患者标本中均发现了这种新型病毒。高通量测序技术检测病毒基因序列,显示与既往蝙蝠SARS样病毒基因组86.9%的同源性,并产生独立的进化亚枝。尽管如此,它不同于SARS-CoV 和MERS-CoV,属于一种新型β冠状病毒,并可能是此次武汉肺炎的元凶
 

电镜下2019-nCoV冠状病毒形状(A)及其在患者呼吸道上皮细胞中存在的证据(B)
 

研究者根据本次研究,开发了针对病毒基因ORF1ab,N和E区域的检测试剂,引物等信息已与WHO共享。当然,接下来还需做免疫组化的病毒抗原检测、血液中IgM和IgG抗体检测,以及动物实验。最重要的是流行病学研究发现其传播模式,病毒复制间歇以及感染后的临床表现等,以预防、控制和阻止其流行。

美国爱荷华大学Stanley Perlman教授作了述评(Another Decade, Another Coronavirus):新的十年,新的病毒。


Stanley Perlman教授
美国爱荷华大学微生物和免疫学专家
 

1. 病毒基因测序表明,2019-nCoV病毒与SARS-CoV有着75%-80%的相同序列,与蝙蝠冠状病毒同源性更高。已完成的病毒基因测序工作有利于开发基于qPCR技术的快速检测试剂盒以及药物研发


2. 2019-nCoV似乎与SARS-CoV具有一样的细胞受体(hACE2)因此只有当下呼吸道症状出现后才可能发生传播。但不排除像SARS-CoV发生变异的可能,与细胞受体结合增强,毒性增强。实际上,此病毒可能容易突变和重组频繁


3. 2019-nCoV很可能会表现的像SARS-CoV,并进一步适应人类宿主,增强与细胞受体(hACE2)结合的能力。目前需要获取更多样本验证这种可能。


4. 2019-nCoV的自然宿主目前推测可能是蝙蝠,其传播途径有待进一步确定。


5. 2002~2003年的SARS事件表明公众的恐惧对社会经济造成巨大影响


6. 2019-nCoV很可能通过大的液滴和直接接触传播,少部分通过气溶胶和污染物传播。社区防疫检疫、及早诊断以及普通防护措施对于控制疫情非常关键。

 
医用外科口罩或N95口罩可以有效抵御飞沫传播
 
Coronavirus Infections—More Than Just the Common Cold
题目:冠状病毒感染-远非普通感冒
期刊:JAMA Published>(本内容力图对文献要点进行翻译,仅做参考!有兴趣者请参阅原文)

点击此处,即可查看原文


长期以来人类冠状病毒 (HCoVs)都被认为致病性不强,仅导致普通流感症状。但是非典型肺炎病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合症冠状病毒(MERS-CoV)的出现改变了这个看法,2019年发现于武汉的新病毒2019-nCoV导致的疫情则发展迅速。

2012年MERS的全球传播范围和传播途径,来源于WHO官网

冠状病毒分为四大类:α、β、γ和δ,其中α和β已被发现可传染人致病。冠状病毒大部分见于蝙蝠,提示蝙蝠是它们的主要源头。人类住所周围的哺乳动物则可充当中间宿主,进一步造成病毒基因的重组和变异。

2002年肆虐中国的SARS病毒人传人的现象主要发生在医院,因为病毒受体(ACE2)主要存在于下呼吸道而非上呼吸道。这就造成上呼吸道症状不明显,而病毒脱落高峰发生迟(约10天)。而气管插管又加剧其院内传播。SARS-CoV证明其可跨越种属向人类传播。

2012年另一种冠状病毒MERS-CoV在沙特被鉴定。其主要在院内传播而非社区传播。推测其源头为蝙蝠,而单峰骆驼则充当了中间宿主。

目前认为蝙蝠是各种传人冠状病毒的传播源头
 

果子狸和单峰骆驼则分别是SARS和MERS病毒的中间宿主,图片来自网络
 
2020年1月10日,上海公共卫生临床中心及公共卫生学校的研究者和合作者,公布了2019-nCoV的全基因组序列并提交给公共数据库(是否与中国CDC同时研究需确证)。初步分析显示2019-nCoV与SARS-CoV具有一些氨基酸序列同源性,并可能使用ACE2作为受体。15例医疗工作者被感染证明其具有人传人能力。目前看,其致死率低于SARS-CoV(约10%)和MERS-CoV(约36%)。但本次疫情的范围和程度有待观察。

基于既往抗冠状病毒流行经验,新的诊断方法已被采用。广谱抗病毒药物,如remdesivir(一种RNA聚合酶抑制剂)、lopinavir/ritonavir以及干扰素β曾在动物实验中发挥抗MERS-CoV病毒作用,并正用于评估抗2019-nCoV病毒作用。疫苗也正在研发中,从获取病毒基因序列到1期临床试验,目前已能将SARS等冠状病毒疫苗研发从20个月压缩至3.25个月。针对本次新型冠状病毒肺炎爆发,使用mRNA疫苗技术有希望更快研制出疫苗。

lopinavir/ritonavir抗病毒制剂已用于HIV的治疗
 
针对Ebola病毒疾病研发的疫苗
 
尽管此次疫情发展很难预测,但是当务之急是迅速的采取公共卫生防疫措施以及及时有效的治疗方法,本次疫情提醒我们针对传染疾病需做好持续准备。

Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China
题目:中国武汉2019新型冠状病毒感染患者的临床特点
期刊:The Lancet Published>(本内容力图对文献要点进行翻译,仅做参考!有兴趣者请参阅原文)

点击此处,即可查看原文


研究人员将临床特征、实验室检验和影像学结果与流行病学数据相结合,分析了2019年12月16日至2020年1月2日期间在武汉市入院的首批41例确诊感染2019-nCoV的病例。

结果显示,在首批41例确诊病例中,25-49岁患者占比49%,50-64岁患者占比34%,患者中位年龄为49岁,多数去过华南海鲜市场(66%,27例),以男性为主(73%,30例)。



与SARS一样,大多数感染者为健康人,仅有不到三分之一的病例合并慢性疾病,例如糖尿病(20%,8例),高血压(15%,6例)和心血管疾病(15%,6例)。


初步数据表明,首批41例新型冠状病毒感染和SARS之间存在部分相似症状,最常见的症状为发烧、咳嗽、肌痛或疲劳,所有患者都并发肺炎。但存在一些重要的区别,比如2019-nCoV感染患者不存在上呼吸道症状(例如流涕、打喷嚏、喉咙疼痛)和肠道症状(例如腹泻)(肠道症状为近期确认)。大约三分之一的患者出现了急性呼吸窘迫综合征(29%,12例)或接受了重症监护(32%,13例),其中6人死亡。截至2020年1月22日,纳入研究的41名患者已有28名(68%)出院。

研究人员同时指出该研究的一些局限性,包括由于病例数有限,难以确切评估与疾病严重性和死亡率相关的危险因素。他们呼吁在门诊和社区中进行更大规模的研究以确认2019-nCoV感染患者的完整疾病谱,“目前还很难准确掌握与这种新型病毒相关的死亡率,因为往往在疫情流行的初始阶段更容易关注到那些危重病例,而可能忽略了较轻或无症状的病例。”

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