神经内科是国家重点学科、重庆市重点学科，医学博士、硕士学位授予点、博士后流动站，国家药物临床研究机构专业，综合卒中中心、重庆市卒中中心，重庆市老年神经疾病研究中心，重庆市脑电图及神经电生理质量控制中心，天坛医院神经介入联盟单位，国家帕金森病中心联盟单位，中国心身医学教育联盟基地，重庆市护理学会脑卒中专科护士培训基地。在20世纪60年代，来自上海医学院的汤云鹏教授组建了神经病学专业，20世纪90年代，魏运枝主任为神经病学的发展打下了的基础，1999年全国知名专家、博士生导师、国家特殊津贴获得者胡长林教授创建了神经内科。目前重庆医科大学附属第二医院神经内科已形成一个由专科病房、神经重症病房、神经电生理诊断中心、神经康复室等组成的设备精良、诊疗技术先进、结构完整、医教研全面发展的临床专科。

科室共有180张床位（渝中院区、江南院区），拥有视频脑电图、动态脑电图、睡眠分析、脑电地形图仪、诱发电位仪、Keypoint标准型肌电图仪、经颅多谱勒诊断栓子监测系统、电子生物反馈等先进设备；拥有一支诊疗技术精湛、学术造诣深厚的团队。其中有国务院政府特殊津贴获得者1名，重庆市神经病学学术技术带头人2名，重庆市322人才工程第二层次人选1名，博士研究生导师3名，硕士研究生导师9名。神经内科共有医生26名，具有博士学位者18人，目前教授/主任医师8名，副教授/副主任医师4人，主治医师/讲师10人。

科室承担了包括国家自然科学基金、科技部“十一五”、“十二五”科技支撑计划、重庆市自然科学基金等项目，获得国家科技进步奖二等奖、四川省科技进步奖一奖重庆市科技进步奖二等奖等，主编《癫痫治疗学》、《神经病学疑难病例剖析》（人民卫生出版社），为《神经病学》教材案例版、英文版、5+3版的副主编（人民卫生出版社）。

特色诊疗：

神经内科专科可诊治神经科各种疾病，如急慢性脑血管病、癫痫、脑炎、脑膜炎、帕金森氏病、痴呆、多发性硬化、肌肉疾病、周围神经病、眩晕、头痛、失眠等。在脑血管疾病、癫痫、帕金森氏病、痴呆等疾病诊疗方面具有领先优势，在西南地区享有一定盛誉，病员辐射整个直辖市所有区县市及云、贵、川、陕西等。